Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FANCLQ9NW38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCLQ9NW38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FANCLQ9NW38 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCLQ9NW38 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCLQ9NW38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FANCLQ9NW38 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FANCLQ9NW38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FANCLQ9NW38 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms