Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1GALT1Q9NS00 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1GALT1Q9NS00 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1GALT1Q9NS00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1GALT1Q9NS00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1GALT1Q9NS00 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1GALT1Q9NS00 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms