Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A20Q9NP91 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A20Q9NP91 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A20Q9NP91 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A20Q9NP91 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC6A20Q9NP91 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC6A20Q9NP91 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A20Q9NP91 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC6A20Q9NP91 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC6A20Q9NP91 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC6A20Q9NP91 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A20Q9NP91 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A20Q9NP91 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A20Q9NP91 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC6A20Q9NP91 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms