Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SARS2Q9NP81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SARS2Q9NP81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SARS2Q9NP81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SARS2Q9NP81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARS2Q9NP81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SARS2Q9NP81 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARS2Q9NP81 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms