Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN7BQ9HAP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN7BQ9HAP6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN7BQ9HAP6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN7BQ9HAP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7BQ9HAP6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms