Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SUDS3Q9H7L9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SUDS3Q9H7L9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SUDS3Q9H7L9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUDS3Q9H7L9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SUDS3Q9H7L9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUDS3Q9H7L9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUDS3Q9H7L9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms