Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPA3Q9H6K4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OPA3Q9H6K4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OPA3Q9H6K4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OPA3Q9H6K4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OPA3Q9H6K4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms