Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA6CQ9H3T2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6CQ9H3T2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6CQ9H3T2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA6CQ9H3T2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA6CQ9H3T2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA6CQ9H3T2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms