Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3L0

MMADHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D protein, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMADHCQ9H3L0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MMADHCQ9H3L0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MMADHCQ9H3L0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMADHCQ9H3L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMADHCQ9H3L0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMADHCQ9H3L0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMADHCQ9H3L0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMADHCQ9H3L0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms