Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX25Q9H3E2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX25Q9H3E2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX25Q9H3E2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX25Q9H3E2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX25Q9H3E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX25Q9H3E2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX25Q9H3E2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX25Q9H3E2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms