Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDCL3Q9H2J4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL3Q9H2J4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDCL3Q9H2J4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCL3Q9H2J4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms