Protein–RNA interactions for Protein: Q9H082

RAB33B, Ras-related protein Rab-33B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33BQ9H082 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB33BQ9H082 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB33BQ9H082 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB33BQ9H082 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB33BQ9H082 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB33BQ9H082 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB33BQ9H082 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33BQ9H082 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB33BQ9H082 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms