Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D6

FHDC1, FH2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHDC1Q9C0D6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHDC1Q9C0D6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHDC1Q9C0D6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHDC1Q9C0D6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FHDC1Q9C0D6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FHDC1Q9C0D6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FHDC1Q9C0D6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FHDC1Q9C0D6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FHDC1Q9C0D6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FHDC1Q9C0D6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FHDC1Q9C0D6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FHDC1Q9C0D6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FHDC1Q9C0D6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FHDC1Q9C0D6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FHDC1Q9C0D6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FHDC1Q9C0D6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FHDC1Q9C0D6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms