Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CECR2Q9BXF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CECR2Q9BXF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC50.24■■■■■ 5.63
CECR2Q9BXF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CECR2Q9BXF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC50.19■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC50.13■■■■■ 5.62
CECR2Q9BXF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.12■■■■■ 5.61
CECR2Q9BXF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.09■■■■■ 5.61
CECR2Q9BXF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC50.09■■■■■ 5.61
CECR2Q9BXF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
CECR2Q9BXF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
CECR2Q9BXF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
CECR2Q9BXF3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
CECR2Q9BXF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
CECR2Q9BXF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC49.9■■■■■ 5.58
CECR2Q9BXF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
CECR2Q9BXF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
CECR2Q9BXF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
CECR2Q9BXF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
CECR2Q9BXF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
CECR2Q9BXF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
CECR2Q9BXF3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
CECR2Q9BXF3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
CECR2Q9BXF3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC49.72■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
CECR2Q9BXF3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
CECR2Q9BXF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC49.68■■■■■ 5.54
CECR2Q9BXF3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
CECR2Q9BXF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.65■■■■■ 5.54
CECR2Q9BXF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
CECR2Q9BXF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC49.61■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.57■■■■■ 5.53
CECR2Q9BXF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC49.56■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC49.51■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
CECR2Q9BXF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
CECR2Q9BXF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
CECR2Q9BXF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
CECR2Q9BXF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CECR2Q9BXF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CECR2Q9BXF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC49.45■■■■■ 5.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms