Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRIP1Q9BX63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRIP1Q9BX63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRIP1Q9BX63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRIP1Q9BX63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRIP1Q9BX63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BRIP1Q9BX63 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BRIP1Q9BX63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRIP1Q9BX63 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms