Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC94Q9BW85 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC94Q9BW85 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC94Q9BW85 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC94Q9BW85 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC94Q9BW85 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC94Q9BW85 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC94Q9BW85 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms