Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC2P3Q9BVR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC2P3Q9BVR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC2P3Q9BVR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC2P3Q9BVR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC2P3Q9BVR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC2P3Q9BVR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC2P3Q9BVR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms