Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PI4K2AQ9BTU6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PI4K2AQ9BTU6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PI4K2AQ9BTU6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PI4K2AQ9BTU6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PI4K2AQ9BTU6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms