Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYT17Q9BSW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SYT17Q9BSW7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYT17Q9BSW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYT17Q9BSW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SYT17Q9BSW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SYT17Q9BSW7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SYT17Q9BSW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYT17Q9BSW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYT17Q9BSW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYT17Q9BSW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYT17Q9BSW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms