Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNS3Q9BQ31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNS3Q9BQ31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNS3Q9BQ31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNS3Q9BQ31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNS3Q9BQ31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNS3Q9BQ31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms