Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.69■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC48.66■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC48.65■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
RSF1Q96T23 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC48.61■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.6■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
RSF1Q96T23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC48.55■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC48.5■■■■■ 5.36
RSF1Q96T23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC48.47■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.44■■■■■ 5.35
RSF1Q96T23 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
RSF1Q96T23 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
RSF1Q96T23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
RSF1Q96T23 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
RSF1Q96T23 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
RSF1Q96T23 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC48.28■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC48.27■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
RSF1Q96T23 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
RSF1Q96T23 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC48.14■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.3
RSF1Q96T23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
RSF1Q96T23 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
RSF1Q96T23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
RSF1Q96T23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC48.09■■■■■ 5.29
RSF1Q96T23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
RSF1Q96T23 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC48.03■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC48.02■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
RSF1Q96T23 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
RSF1Q96T23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC47.97■■■■■ 5.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms