Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDLIM2Q96JY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDLIM2Q96JY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDLIM2Q96JY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PDLIM2Q96JY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDLIM2Q96JY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDLIM2Q96JY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PDLIM2Q96JY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDLIM2Q96JY6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDLIM2Q96JY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms