Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREB3L1Q96BA8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L1Q96BA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB3L1Q96BA8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3L1Q96BA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms