Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2FQ969M7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2FQ969M7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2FQ969M7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2FQ969M7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBE2FQ969M7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2FQ969M7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2FQ969M7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2FQ969M7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms