Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMTQ93088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BHMTQ93088 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BHMTQ93088 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BHMTQ93088 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BHMTQ93088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BHMTQ93088 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BHMTQ93088 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BHMTQ93088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BHMTQ93088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BHMTQ93088 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BHMTQ93088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BHMTQ93088 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMTQ93088 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BHMTQ93088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BHMTQ93088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms