Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA1Q92743 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA1Q92743 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA1Q92743 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTRA1Q92743 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA1Q92743 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA1Q92743 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms