Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSPC1Q8WXF1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSPC1Q8WXF1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSPC1Q8WXF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSPC1Q8WXF1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSPC1Q8WXF1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms