Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3BQ8TF42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBASH3BQ8TF42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBASH3BQ8TF42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBASH3BQ8TF42 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3BQ8TF42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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