Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPATA18Q8TC71 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SPATA18Q8TC71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPATA18Q8TC71 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPATA18Q8TC71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPATA18Q8TC71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPATA18Q8TC71 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPATA18Q8TC71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms