Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf47Q8NEP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C17orf47Q8NEP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C17orf47Q8NEP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C17orf47Q8NEP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms