Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSD4Q8NDX1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSD4Q8NDX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSD4Q8NDX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSD4Q8NDX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSD4Q8NDX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSD4Q8NDX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms