Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PQLC1Q8N2U9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PQLC1Q8N2U9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PQLC1Q8N2U9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PQLC1Q8N2U9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PQLC1Q8N2U9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PQLC1Q8N2U9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PQLC1Q8N2U9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms