Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCML4Q8N228 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCML4Q8N228 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCML4Q8N228 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCML4Q8N228 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCML4Q8N228 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SCML4Q8N228 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCML4Q8N228 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCML4Q8N228 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCML4Q8N228 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCML4Q8N228 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms