Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYS1

PM20D2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PM20D2Q8IYS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PM20D2Q8IYS1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PM20D2Q8IYS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PM20D2Q8IYS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PM20D2Q8IYS1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PM20D2Q8IYS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PM20D2Q8IYS1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PM20D2Q8IYS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms