Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APLFQ8IW19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APLFQ8IW19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APLFQ8IW19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APLFQ8IW19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APLFQ8IW19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APLFQ8IW19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms