Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAV3Q8IVL0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAV3Q8IVL0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAV3Q8IVL0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NAV3Q8IVL0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NAV3Q8IVL0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAV3Q8IVL0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAV3Q8IVL0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms