Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATAD2AQ86YP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATAD2AQ86YP4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GATAD2AQ86YP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GATAD2AQ86YP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2AQ86YP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATAD2AQ86YP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATAD2AQ86YP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATAD2AQ86YP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms