Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC84Q86UT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC84Q86UT8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC84Q86UT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC84Q86UT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC84Q86UT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC84Q86UT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC84Q86UT8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC84Q86UT8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC84Q86UT8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC84Q86UT8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC84Q86UT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC84Q86UT8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms