Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms