Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM43BQ6ZT52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM43BQ6ZT52 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM43BQ6ZT52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM43BQ6ZT52 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FAM43BQ6ZT52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM43BQ6ZT52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM43BQ6ZT52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM43BQ6ZT52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms