Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQQ6

WDR87, WD repeat-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 2,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR87Q6ZQQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR87Q6ZQQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR87Q6ZQQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR87Q6ZQQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
WDR87Q6ZQQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR87Q6ZQQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR87Q6ZQQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR87Q6ZQQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms