Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNI2Q6ZMN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNI2Q6ZMN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNI2Q6ZMN8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNI2Q6ZMN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNI2Q6ZMN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNI2Q6ZMN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNI2Q6ZMN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNI2Q6ZMN8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms