Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNCKQ6P2M8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNCKQ6P2M8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNCKQ6P2M8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PNCKQ6P2M8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNCKQ6P2M8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNCKQ6P2M8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms