Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEL1L3Q68CR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEL1L3Q68CR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEL1L3Q68CR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEL1L3Q68CR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SEL1L3Q68CR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEL1L3Q68CR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEL1L3Q68CR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SEL1L3Q68CR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEL1L3Q68CR1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEL1L3Q68CR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms