Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSBN1Q5VWQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RSBN1Q5VWQ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RSBN1Q5VWQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSBN1Q5VWQ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSBN1Q5VWQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSBN1Q5VWQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSBN1Q5VWQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms