Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MLIPQ5VWP3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MLIPQ5VWP3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLIPQ5VWP3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLIPQ5VWP3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MLIPQ5VWP3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLIPQ5VWP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MLIPQ5VWP3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MLIPQ5VWP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms