Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDHAF4Q5VUM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDHAF4Q5VUM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SDHAF4Q5VUM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDHAF4Q5VUM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SDHAF4Q5VUM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDHAF4Q5VUM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDHAF4Q5VUM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDHAF4Q5VUM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDHAF4Q5VUM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SDHAF4Q5VUM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDHAF4Q5VUM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDHAF4Q5VUM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDHAF4Q5VUM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms