Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT6Q5T7P8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT6Q5T7P8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYT6Q5T7P8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT6Q5T7P8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYT6Q5T7P8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT6Q5T7P8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT6Q5T7P8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms