Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WASHC2DQ5SRD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WASHC2DQ5SRD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WASHC2DQ5SRD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WASHC2DQ5SRD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
WASHC2DQ5SRD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms