Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FBXO47Q5MNV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO47Q5MNV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FBXO47Q5MNV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FBXO47Q5MNV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FBXO47Q5MNV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FBXO47Q5MNV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FBXO47Q5MNV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FBXO47Q5MNV8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FBXO47Q5MNV8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO47Q5MNV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO47Q5MNV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms